生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么参数需要修改，结果可以出来，却把握不住对还是错。
学习生信从来就不是一个简单的事，需要做好持久战的心理准备。
在学习时，我们都希望由浅入深的逐步深入，不断地练习和实践，这就是为什么我们需要一本书，因为书很系统。但生信发展的历史短于计算机编程的历史，如果想要一门程序设计的入门数据，每种语言都可以找到几本。但想要一个囊括生信的书，就有些难了。本身生信跨领域，需要多学科的知识，而其内部又有不少分子，都囊括了太大，包括的少又有些隔靴搔痒的感觉。
我们当时都是零基础下自学Linux,
自学Python，自学R，自学高通量测序；这些学习经历，之前都零星地记录在博客里。现在回头去看几年前自己记录的东西，觉得好简单，而当时却费了很大的力气。这些零星的随手记，当时也只是为了自己看，到现在确实只有自己能看得懂，不便惠及更多的人。
因此我们创建了生信宝典，希望从不同的角度传播知识。这个不同有三点含义，一是形式上的不同，摒弃之前主编们单人作战想写啥就写啥，而是有组织有计划的内容聚合，提供一系列的教程，由入门到提高。二是内容的不同，不去用网上现有教程的通用数据做例子，而是拿实际生物数据，讲述如何解释生信中普遍碰到的问题，讲述如何处理自己的数据。三是立足点不同。在写作时，我们回到了当年，在回忆中用整个阶段的学习去指导当初的那个小白，从那些会了的人觉得微不足道而不会的人又迈不过的坎入手，直击痛点。知识点的收录依据不是是否炫酷，是否难，而是是否必要。如果必要，再简单，也要提及；如果不必要，再炫酷，也暂不纳入。
通过大量的生信例子、关键的注释和浓缩的语句形成下面的一系列学习教程。每一篇内容都不多，可以当做小说阅读，也可以跟着去练，反复几遍，每读一次都会有不同的收获和体会。
生物信息学包含生物数据分析、数据可视化、重复工作程序化，是生物、医学科研必备的技能之一。生信宝典精心组织生信学习系列教程、生信工具精品教程，通过大量的生信例子、关键的注释、浓缩的语句和录制的视频帮助快速掌握生信知识。
教程合集
生信宝典Py3_course.pdf
生信宝典-R学习教程.pdf
加拿大生信课程
国外生信教程免费领 加拿大生信开源学习资源Bioinformatics.ca
Bioinformatics_for_Cancer_Genomics
Informatics_on_High-Throughput_Sequencing_Data
Informatics_for_RNA-Seq_Analysis
Analysis_of_Metagenomic_Data
Informatics_and_Statistics_for_Metabolomics
Bioinformatics_of_Genomic_Medicine
Epigenomic_Data_Analysis
Pathway_and_Network_Analysis_of_omics_Data
Infectious_Disease_Genomic_Epidemiology
Illumina测序应用手册
Illumina测序仪比较和各种测序应用模式图，助力了解高通量测序
RNA层面
DNA层面
单细胞层面
系列教程
画图手册 | ImageGP：今天你“plot”了吗？
知乎阅读三百万的生信学习指南
当我们谈论生信的时候我们在谈什么
生物信息之程序学习
关于编程学习的一些思考
该如何自学入门生物信息学
生信宝典视频教程
转录组分析的正确姿势
收藏 你想要的生信学习系列教程-宝典在手，生信无忧
生信的系列书籍
文章用图的修改和排版 (1)
文章用图的修改和排版 (2)
简单强大的在线绘图
简单强大的在线绘图-升级版
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机器学习算法-随机森林之决策树R 代码从头暴力实现（2）
机器学习算法-随机森林之决策树R 代码从头暴力实现（3）
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哈佛大学单细胞课程：笔记汇总前篇
哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （一）
哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （二）
哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （三）
哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （四）
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哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （九）
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一个R包完成单细胞基因集富集分析 （全代码）
单细胞文章专列——细胞图谱
哈佛大学单细胞课程|笔记汇总（1-9）
万字长文：单细胞表观基因组学的黄金时代（数位华人科学家悉数登场）
GEO/TCGA数据
UCSC XENA – 集大成者(TCGA, ICGC)
ICGC数据库使用
TCGA数据库在线使用
BROAD开发的TCGA分析平台，强大的下载功能
cBioPortal功能强大的TCGA再分析平台
这是数据更新最实时的TCGA网站，功能强大
不懂R，如何进行GEO数据库表达谱的差异分析、富集分析、蛋白互作、可视化？
典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) – Limma差异分析、火山图、功能富集
典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) – 数据获取到标准化
为什么GEO2R/GEOquery的结果可能是错的？
这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350次
GEPIA|神一样的TCGA可视化网站
用了这么多年的PCA可视化竟然是错的！！！
分享一个完美的工具：多数据库集合，研究基因组学癌症必备
TISIDB：这个科研工具能助你顺利发高分肿瘤免疫文章
超详细的GEO数据上传攻略，一看就会
扩增子三步曲
1图表解读-理解文章思路
2分析流程-把握分析细节
扩展1：视频教程-夯实分析思路
扩展2：QIIME2教程-了解分析趋势
3统计绘图-冲击高分文章
易生信-扩增子教程01-基本概念
易生信-扩增子教程02-真菌引物选择
收藏-手把手带你重现菌群封面文章全部结果图表
如何简化美化LEfSe分析结果中的Cladogram图
FEMS综述: 如何从微生物网络中的“毛线球”理出头绪(3万字长文带你系统学习网络)
Nature子刊：教你零基础开展微生物组数据分析和可视化
为什么Alpha多样性的输入数据会是它？
扩增子和宏基因组数据分析流程和可视化方案—刘永鑫(南京，2020年10月27日）
宏基因组教程
Nature综述：Microbiota, metagenome, microbiome傻傻分不清
微生物组入门必读 宏基因组实操课程
扩增子图表解读-理解文章思路
扩增子分析流程-把握分析细节
扩增子统计绘图-冲击高分文章
宏基因组分析教程
4500元的微生物组培训资料
宏基因组分析教程合集
宏基因组分析教程合集和往期课程PPT分享
人类微生物组计划 – 宏基因组/16S分析流程 bioBakery
宏基因组分析专题
1 背景知识-Shell入门与本地blast实战
2 数据质控fastqc, Trimmomatic, MultiQC, khmer
3 组装拼接MEGAHIT和评估quast
4 基因注释Prokka
5 基于Kmer比较数据集sourmash
6 不比对快速估计基因丰度Salmon
7 bwa序列比对, samtools查看, bedtools丰度统计
8 分箱宏基因组binning, MaxBin, MetaBin, VizBin
9 组装assembly和分箱bin结果可视化—Anvio
10 绘制圈图-Circos安装与使用
MetaPhlAn2分析有参宏基因组
ChIP-seq专题
ChIP-seq基本分析流程
从Richard Young教授的系列研究看超级增强子发现背后的故事 (附超级增强子鉴定代码)
表观遗传小白逆袭之道：从这 19 个视频开始吧！
Bedtools使用简介
2018 升级版Motif数据库Jaspar
MotifStack：多motif序列比较和可视化
一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点
AnimalTFDB 3.0 动物转录因子注释和预测的综合资源库
Cell重磅综述：关于人类转录因子，你想知道的都在这
Linux 全介绍
这个为生信学习打造的开源Bash教程真香！！（目录更新）！
PATH和path，傻傻分不清
Linux – 总目录
Linux – 文件和目录
Linux – 文件操作
Linux – 文件内容操作
Linux – 环境变量和可执行属性
Linux – 管道、标准输入输出
Linux – 命令运行监测和软件安装
Linux – 常见错误和快捷操作
Linux – 文件列太多，很难识别想要的信息在哪列；别焦急，看这里。
Linux – 文件排序和FASTA文件操作
Linux – 应用Docker安装软件
Linux – 一文掌握Conda软件安装：虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移
Linux – 服务器数据定期同步和备份方式
Linux – VIM的强大文本处理方法
Linux – 查看服务器配置信息
Linux – SED操作，awk的姊妹篇
Linux – 常用和不太常用的实用awk命令
Linux – 那些查找命令
Linux – 原来你是这样的软连接
Bash概论 – Linux系列教程补充篇
Nature Method：Bioconda解决生物软件安装的烦恼
Linux下文件内容更新了文件夹时间戳却没变？
如何获取目标基因的转录因子（上）——Biomart下载基因和motif位置信息
如何获取目标基因的转录因子（下）——Linux命令获取目标基因TF
生信人写程序1. Perl语言模板及配置
生信人写程序2. Editplus添加Perl, Shell, R, markdown模板和语法高亮
手把手教你生信分析平台搭建
Windows轻松实现linux shell环境：gitforwindows
gitforwindows教程：这个40M的小工具助你在windows下处理数据如虎添翼！！
开启win10内置Linux子程序
Docker的基本使用-Ubuntu18.04
Bioconda软件安装神器：多版本并存、环境复制、环境导出
收藏 15 个你非了解不可的 Linux 特殊字符，妈妈再也不用担心我看不懂这些符号了！
有了这些，文件批量重命名还需要求助其它工具吗？
软件安装不上，可能是网速慢！Conda/R/pip/brew等国内镜像大全拿走不谢~~
耗时很长的程序忘加nohup就运行了怎么办？
一句话加速grep近30倍
朴实无华的4条命令用起来！
这21个不太好搜索其含义的特殊符号你都知道吗？
推荐2个命令快速在本地和服务器之间上传下载文件
如何快速从基因组中提取基因、转录本、蛋白、启动子、非编码序列？
三大开源生信基础教程和视频课程
seqkit：序列梳理神器-统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等30项全能
图示不写程序如何根据dbSNP rs号批量获取基因组坐标、相关基因和表型影响
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CIRCOS圈图绘制 – circos安装
CIRCOS圈图绘制 – 最简单绘图和解释
CIRCOS圈图绘制 – 染色体信息展示和调整
CIRCOS增加热图、点图、线图和区块属性
R统计和作图
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别人运行的好好的R代码，到我这怎么就冲突了？
R语言中这些你想知道含义又不知道怎么查的特殊符号
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ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)
在B站学习大名鼎鼎的StatQuest 系列统计和生信分析视频（中文字幕）- 也见证助理教授到创业者的华丽转身
使用R语言的正确姿势，R包干货奉献
用rmarkdown定制你的数据分析报告
超详细的热图绘制教程(5000余字)，真正的保姆级教程
R」ggplot2拼图包patchwork推荐与使用
高通量数据中批次效应的鉴定和处理 – 系列总结和更新
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Graphpad，经典绘图工具初学初探
你的包佩奇了吗？试试新版Rstudio，自动提醒缺失包！
原来Rstudio还可以这么使用，又方便了一些
在R中赞扬下努力工作的你，奖励一份CheatShet
别人的电子书，你的电子书，都在bookdown
R语言 – 入门环境Rstudio
R语言 – 热图绘制 (heatmap)
R语言 – 基础概念和矩阵操作
R语言 – 热图简化
R语言 – 热图美化
R语言 – 线图绘制
R语言 – 线图一步法
R语言 – 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）
R语言 – 箱线图一步法
R语言 – 火山图
R语言 – 富集分析泡泡图
R语言 – 散点图绘制
R语言 – 韦恩图
R语言 – 柱状图
R语言 – 图形设置中英字体
R语言 – 非参数法生存分析
R语言 – 绘制seq logo图
R语言 – 迅速把函数包装成R包
R语言 – 把函数包装成R包
WGCNA分析，简单全面的最新教程
psych igraph：共表达网络构建
245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵
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主成分分析PCA
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富集分析DotPlot，可以服
Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图
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一个函数抓取代谢组学权威数据库HMDB的所有表格数据
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network3D 交互式网络生成
Seq logo 在线绘制工具——Weblogo
生物AI插图素材获取和拼装指导
如何使用AI进行SCI组图
如何使用AI画一个简单的细胞通路图?
一分钟绘制磷脂双分子层：AI零基础入门和基本图形绘制
AI科研绘图（二）：模式图的基本画法
图像处理R包magick学习笔记
SOM基因表达聚类分析初探
利用gganimate可视化全球范围R-Ladies（R社区性别多样性组织）发展情况
你知道R中的赋值符号箭头(<-)和等号（=）的区别吗？
R语言可视化学习笔记之ggridges包
利用ComplexHeatmap绘制热图(一)
ggplot2学习笔记之图形排列
R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换
用R在地图上绘制网络图的三种方法
PCA主成分分析实战和可视化 附R代码和测试数据
iTOL快速绘制颜值最高的进化树！
12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化
编程模板-R语言脚本写作：最简单的统计与绘图，包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出
R语言统计入门课程推荐——生物科学中的数据分析Data Analysis for the Life Sciences
数据可视化基本套路总结
你知道R中的赋值符号箭头<-和等号=的区别吗？
使用dplyr进行数据操作30例
交集intersect、并集union、找不同setdiff
R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换
1数据类型（向量、数组、矩阵、 列表和数据框）
2读写数据所需的主要函数、与外部环境交互
3数据筛选——提取对象的子集
4向量、矩阵的数学运算
5控制结构
6函数及作用域
7认识循环函数lapply和sapply
8分解数据框split和查看对象str
9模拟—随机数、抽样、线性模型
1初识ggplot2绘制几何对象
2图层的使用—基础、加标签、注释
3工具箱—误差线、加权数、展示数据分布
4语法基础
5通过图层构建图像
6标度、轴和图例
7定位-分面和坐标系
8主题设置、存储导出
9绘图需要的数据整理技术
创建属于自己的调色板
28个实用绘图包，总有几个适合你
热图绘制
R做线性回归
绘图相关系数矩阵corrplot
相关矩阵可视化ggcorrplot
绘制交互式图形recharts
交互式可视化CanvasXpress
聚类分析factoextra
LDA分析、作图及添加置信-ggord
解决散点图样品标签重叠ggrepel
添加P值或显著性标记ggpubr
Alpha多样性稀释曲线rarefraction curve
堆叠柱状图各成分连线画法：突出组间变化
冲击图展示组间时间序列变化ggalluvial
桑基图riverplot
微生物环境因子分析ggvegan
五彩进化树与热图更配ggtree
多元回归树分析mvpart
随机森林randomForest 分类Classification 回归Regression
加权基因共表达网络分析WGCNA
circlize包绘制circos-plot
R语言搭建炫酷的线上博客系统
维恩(Venn)图绘制工具大全 （在线 R包）
R包circlize：柱状图用腻了？试试好看的弦状图
获取pheatmap聚类后和标准化后的结果
聚类热图怎么按自己的意愿调整分支的顺序？
增强火山图，要不要试一下？
esquisse: 快速可视化图形的 Rstudio 插件
一个震撼的交互型3D可视化R包 – 可直接转ggplot2图为3D
赠你一只金色的眼 – 富集分析和表达数据可视化
是Excel的图，不！是R的图
道友，来Rstudio里面看动画了
用了这么多年的PCA可视化竟然是错的！！！
主成分分析PCA
万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等
2019年诺贝尔生理医学奖揭晓 |动图展示历年生理学奖
2019年诺贝尔化学奖揭晓 |八一八，那些年的诺贝尔化学奖
cellassign：用于肿瘤微环境分析的单细胞注释工具（9月Nature）
ggThemeAssist｜鼠标调整主题，并返回代码
ggcor |相关系数矩阵可视化
这也太简单了吧！一个函数完成数据相关性热图计算和展示
ggcor在微生物生态领域的使用实战
昨天的science组合图换方案了
画图手册 | ImageGP：今天你“plot”了吗？
R语言一键批量完成差异统计和可视化
gggenes绘制多物种基因结构比较
数据可视化完美指南-R-python
Pathview包：整合表达谱数据可视化KEGG通路
Matplotlib绘制的27个常用图(附对应代码实现)
让你的单细胞数据动起来！|iCellR(一)
让你的单细胞数据动起来！|iCellR(二)
Celaref | 单细胞测序细胞类型注释工具
SCENIC | 从单细胞数据推断基因调控网络和细胞类型
R变量索引 – 什么时候使用 @或$
手把手重现Science的主图Maptree
可视化之为什么要使用箱线图？
Alpha多样性箱线图(样章，11图2视频)
学会这个BBC，你的图也可以上新闻啦！
ggplot2 图区域放大
iheatmapr包：可交互的热图绘制方法
图形解读系列 | 给你5个示例，你能看懂常用热图使用吗？
这个R包自动注释单细胞数据的平均准确率为83％，使用后我的结果出现了点问题|附全代码
一个R包完成单细胞基因集富集分析 （全代码）
从一套表达和通路数据学习常见的绘图展示方式和报错处理
50个ggplot2可视化案例
ggplot2|详解八大基本绘图要素
从pheatmap无缝迁移至ComplexHeatmap
science-组合图表绘制
竟然被awk生成的随机数给整蒙了，也谈随机数生成种子
cola，一个做consensus clustering的R包
simplifyEnrichment，一个对GO富集结果进行聚类和可视化的工具
esquisse: 快速可视化图形的 Rstudio 插件
利用R代码从UCSC XENA下载mRNA, lncRNA, miRNA表达数据并匹配临床信息
一个函数完成矩阵每一列的数据分布、相关性图绘制和相关性检验
使用阿基米德螺线进行数据可视化
这个网站收集了很多杂志的审稿周期和收稿、拒稿意见，值得看看
采用circlize包绘制Circos图
什么是安斯库姆四重奏？为什么统计分析之前必须要作图？
什么是R方？这6张图会让你终身难忘~
一览R基础包的六个高级绘图函数(盒型boxplot|条形barplot|直方hist|饼pie|dotchart|coplot)
PPT绘制示意图视频 文字版本-一篇就学会
csvtk：表格处理神器-美化、统计、头表、合并、转置、筛选、取样、去冗余 、分列、分类汇总和简单绘图
使用Mfuzz包进行基因表达的时间趋势分析并划分聚类群
在一个热图中使用多个颜色主题
关于统计学，几个简单易懂的小故事
这篇Cell里面的GSEA展示很不错！
从一套表达和通路数据学习常见的绘图展示方式和报错处理
Cibersort免疫浸润的在线分析及R语言代码实现
R包ggrepel解决散点图样品标签重叠，方便筛选样品
图片压缩但质量不减，这个工具很不错
图片质量低怎么办？这个网站很不错！
ggplot2之配对数据差异比较及结果可视化
这个神奇的网站提供各种图的代码供您参考！
一文学会基于R的静态和动态网络绘制
主成分分析的可视化展示
Awesome R
ggplot2实现分半小提琴图绘制基因表达谱和免疫得分
有了它，快速学会RStudio应用
R语言进行TCGA配对样本差异基因分析
利用R代码从UCSC XENA下载mRNA, lncRNA, miRNA表达数据并匹配临床信息
使用ComplexHeatmap绘制3D热图
万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等
ETE – 在线可视化进化树和多序列比对
硬核干货：如果样本量不一一样多，或者不是一一对应关系，如何做差异？相关？
【万字长文】R语言入门学习路线与资源汇总
ggforce|绘制区域轮廓-区域放大-寻找你的“onepiece”
ggplot2绘图点的形状不够用怎么办？
ggplot2绘图如何根据一个变量即区分颜色又区分深浅？
GO/KEGG富集分析泡泡图中为什么基因的数目是小数？
NGS基础和软件应用
OrthoMCL鉴定物种同源基因 （安装 使用）
Rfam 12.0 本地使用 （最新版教程）
轻松绘制各种Venn图
ETE构建、绘制进化树
psRobot：植物小RNA分析系统
生信软件系列 – NCBI使用
掌握这个网站，万方、维普、CNKI等众多数据库文献统统可以免费下载！
拿到基因两眼一抹黑？没关系，先做个基因富集分析吧！
科研小萌新，掌握这些技巧，轻松玩转各个基因！
引起相变的无序结构域（IDRs）怎么预测？跟踪热点，提升文章档次！
如果你经常用PubMed，那么这个插件将非常好用！
基于人工智能的文献检索，导师查找，更聪明
GeenMedical：文献查询、筛选、引用排序、相似文献、全文下载、杂志分区、影响因子、结果导出、杂志评述、直接投稿，一站服务
如何快准狠地找到相关领域的经典文献？
Excel改变了你的基因名，30% 相关Nature文章受影响，NCBI也受波及
这些基因的名字太有才了，研究一下都可以发10分文章
文献检索新姿势，教你如何直搜文中的科研图片！
Endnote X8云同步：家里单位实时同步文献笔记，有网随时读文献
还在慌？Endnote的个性化文献引用助毕业论文一臂之力
参考文献中杂志名字格式混乱问题一次解决 – 修改style是没用的
参考文献中杂志名字格式混乱问题一次解决
实用网站和在线工具推荐
在线浏览器，在线PS，在线AI，在线编程 …
Bioconda软件安装神器：多版本并存、环境复制、环境导出
cellassign：用于肿瘤微环境分析的单细胞注释工具（9月Nature）
NBT|45种单细胞轨迹推断方法比较，110个实际数据集和229个合成数据集
NC |SCALE准确鉴定单细胞ATAC-seq数据中染色质开放特征
截屏工具千千万，用了这个不舍得换
内存小还免费，Adobe Acrobat表示有危机
Nicetools：定一个小目标，先做它个1000个工具
20W 喜爱的Pathview网页版 | 整合表达谱数据KEGG通路可视化
中科院遗传所课题组开发高质量基因组组装软件
中科院研究组新建一种高敏高精度的RNA poly(A)尾巴检测技术
CIRIquant：circRNA定量和剪接体转换识别
超详细的GEO数据上传攻略，一看就会
遇到这个工具前我都是建议文章写好就先投Cell？
iBiology |除了B站，这还有个专业的生科科普网站
嗐，别的95后一天两登Nature，你却还不知道有一款工具可以帮你校对英文文稿和回复审稿意见
三大高通量测序平台芯片通量对比图（请把手机横过来看））
给老板做PPT必备：文字加拼音
经典教材《生物信息学》第二版出版了
我在哥大读博的五年，万字总结
把你的科室做成蛋糕，你能想象是什么样子吗？
科研分享｜一个论文关系网络可视化网站
外显子和基因组基本概念(一)
推荐一个在线全自动智能图片背景扣除工具，效果杠杠的
改写教科书！人类细胞可将RNA序列写入DNA，生命基本定律中心法则遭挑战！
分子进化和系统发育的基础知识
写作有困扰？不知道用什么词？不知道怎么解释不一致的结果？这个网站来帮你。
基因治疗光明现，钾盐钠盐大混战；深度学习助力癌早筛，母亲多动降低后代甲基化
重磅！这个生信神器助你文章秒出图——miRNA与基因互作数据库
鱼不长肢蛇不长脚，多多益善更烦恼？人猴嵌合肥胖有救，生活还要压力要小！
这一路，信念很简单，把书念下去，然后走出去，不枉活一世
给你5分钟，如何讲好科学故事？快来Get白岩松同款方法论
PDX模型不靠谱，土豪来发resource；细菌帮助癌转移，诺奖发现被推翻
分享一个免费好用的桌面便签
你的导师是哪种类型？
4 好青年胃癌低，酒精毒性搞清晰；脱发困扰国内外，运动过多也有害
它卧底多年，只为这一刻给癌症撑腰？柳叶刀预测80年后，中国人口减半为7亿
开展“稳健”的生物信息学研究的9个要点
招聘
山东大学微生物国家重点实验室刘双江组招聘（肠道微生物方向）
西湖大学生命科学学院杨剑教授实验室招聘启事
高薪招聘生物信息工程师-中国科学院深圳先进技术研究院合成所合成生物大设施
华中农业大学资源与环境学院“土壤界面过程与生态安全”团队公开招聘博士后
中山大学附属第一医院精准医学研究院 消化系统肿瘤研究于君课题组招聘启事
中山大学附属第一医院精准医学研究院罗镇华课题组招聘研究人员
西湖大学生命科学学院郭天南课题组智能生物标记物核心实验室 科研人员招聘启事
中国农业科学院农业基因组所 Yuwen Liu课题组招聘
北京大学吴华君课题组计算方向博士后和技术员招聘启示
西北工业大学生态环境学院 叶发育生态研究组诚聘博士后
中科院遗传所曹晓风研究组生物信息工作人员招聘启事
ImageGP
高颜值免费在线绘图工具升级版来了~~~
简单强大的在线绘图
简单强大的在线绘图-升级版
简单强大的在线绘图-第3版
在线WGCNA分析 （直接出交互式结果报告）
在线差异基因分析 （支持自动和指定批次校正）
这个工具可以组合参数画出2种单细胞Marker显示图
高颜值免费在线SCI绘图工具增加上传功能
ImageGP新上几个小工具
如何保证文章中同一组样品在不同子图颜色一致？
推荐一款生信分析工具的集大成者
视频演示 | 功能新增 | 增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种
Venn网络展示富集分析结果
单个基因集富集分析泡泡图绘制
多个基因集富集结果泡泡图绘制展示
无代码调整聚类热图分支顺序
基因表达热图聚类并增加行列注释
热图绘制一个快乐五一
轻轻松松画个热图
续昨天的文章，在火山图标记基因名字
BIC无代码绘制差异基因火山图
无代码绘制基因表达箱线图
什么是倾斜45度的火山图？
在线直接绘制倾斜45度的“火山图”
生信宝典之傻瓜式
生信宝典之傻瓜式 (一) 如何提取指定位置的基因组序列
生信宝典之傻瓜式 (二) 如何快速查找指定基因的调控网络
生信宝典之傻瓜式 (三) 我的基因在哪里发光 – 如何查找基因在发表研究中的表达
生信宝典之傻瓜式 (四) 蛋白蛋白互作网络在线搜索
生信宝典之傻瓜式 (五) 文献挖掘查找指定基因调控网络
生信宝典之傻瓜式 (六) 查找转录因子的靶基因
挖掘PubMed数据库，获取报道的或推测新的基因调控关系
知乎阅读三百万的生信学习指南
当我们谈论生信的时候我们在谈什么
如何使用AI画一个简单的细胞通路图?
NAR｜北大/中科院计算所团队发布基因功能富集分析平台KOBAS-i
生信宝典被分享最多的15篇文章
推荐一个非常好用的在线流程图绘制工具|视频演示
Python
Python极简教程（一）
Python极简教程（二）
Python极简教程（三）
Python极简教程（四）
Python极简教程（五）
Python极简教程（六）
Pandas，让Python像R一样处理数据，但快
Python解析psiBlast输出的JSON文件结果
为啥我的Python这么慢 – 字符串连接 (一)
为啥我的Python这么慢 – 项查找 (二)
Python学习 – 可视化变量赋值、循环、程序运行过程
Python资源
关于Python中的main和编程模板
莫烦Python机器学习
编程新手入门踩过的25个“坑”，你犯过其中哪些错误？
Python文学化编程 – Jupyter notebook使用和插件拓展
Python3中正则表达式使用方法
Python3中BeautifulSoup的使用方法
我用Python开发了个SCI-HUB本地版
手把手 哇！用R也可以跑Python了
Bioconda软件安装神器：多版本并存、环境复制、环境导出
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Matplotlib绘制的27个常用图(附对应代码实现)
Python语法糖之：列表解析、集合解析和字典解析
入门课的入门课，微软推出Python零基础教程，基于原生VS Code
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如何判断一个点是否落在一个平面内
Cytoscape网络图
Cytoscape教程1
Cytoscape之操作界面介绍
新出炉的Cytoscape视频教程
Cytoscape制作带bar图和pie图节点的网络图
Cytoscape: MCODE增强包的网络模块化分析
Cytoscape可视化物种分类树结构
Cytoscape: MCODE包实现网络模块化分析
Cytoscape制作带bar图和pie图节点的网络图
分子对接
来一场蛋白和小分子的风花雪月
《自然》重磅：迄今最大规模人类蛋白互作组诞生
不是原配也可以-对接非原生配体
简单可视化-送你一双发现美的眼睛
你需要知道的那些前奏
文献精读
【劝学篇】张启发院士给自己的博士生写的一封信
他靠一生仅有的三篇论文改变了摩尔根，后来却从生物学界销声匿迹了
人类为啥比小鼠发育更慢？同日两篇《科学》找到意想不到的原因
这份精子保存了1亿年，不仅长度惊人还刷新了一项记录
Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这
知乎阅读三百万的生信学习指南
2018年生信宝典阅读最高文章Top10
数学好真的可以为所欲为啊！论一个你不知道的学科-数理生物学
这些基因的名字太有才了，研究一下都可以发10分文章
人类多能性干细胞研究20周年：起始于5个细胞系，我们未来20年的进步将取决于我们现在做的
许多癌症的发生只是概率问题 专访约翰·霍普金斯大学病理系主任拉尔夫·赫鲁班
肿瘤化疗无效是对预先存在的突变的选择还是诱发新突变，Cell给你答案
“人鸡胚胎”破解生命起源奥秘，百年来首次证实“组织者”存在于人体 ｜《Nature》发表重磅论文
被高中生物骗了这么多年，原来人体内细胞的DNA是有不同的？
周琪院士正面回应：60万一针有用吗？（干细胞治疗）
CRISPR-CAS9发展历程小记
一场大病引起的诺贝尔2017年生理学奖角逐
Science搞反狗脑 – 人脑和狗脑一样？
一篇压根不存在的文献被引用400次？！揭开” 幽灵文献” 的真面目
YANDEX搜索，不翻墙稳定使用近谷歌搜索
Nature我的研究对后人毫无用途：21%的学术论文自发布后从未被引用
SCI-HUB镜像, SSH隧道访问学校内网
为了速成生物学，一位程序员探索了”爆款”基因背后的秘密
Nature邀请6位专家为您支招如何写出一流论文？
Cell：荧光标记out了，AI不用“侵入”也能识别细胞死活和类型
如果你经常用PubMed，那么这个插件将非常好用！
生物研究中不可缺少的数字概念，多少，多大，多快
王秀杰研究组合作发现m6A修饰在小脑发育中的新功能 （附2018上半年m6A研究文章和点评）
把人类宝宝和黑猩猩幼崽一起养大，会发生什么有趣的事情呢？结局可能是有些出乎意料的～～
你体内的细胞“成精了”？居然还互相看对了眼？
父爱无言！科学家首次发现来自爸爸的基因，可以通过胎儿来控制妈妈对宝宝的爱
饿死癌细胞？还是先看看肿瘤中的异常代谢的特征分析和背后的遗传与环境互作吧！
2018Cell系列最好的调控方式-相变，最强综述，未来以来，你在哪
2018“不务正业”的化学奖又发给了生物
2018美日科学家因免疫治疗得诺贝尔生理医学奖-动图展示历年生理学奖
Nature综述-整合组学分析护航健康，推动精准医学时代的到来！
勤能补拙，过目不忘，提高m6A助力好记性？中科院王秀杰/杨运桂合作最新成果
综述：变温动物的适应性免疫
你的DNA都会玩摇滚了，你却还是个音痴
“乱搞”的动物可能只是脸盲？新研究发现24个基因决定动物“忠诚度”
经常喜欢熬夜？也许你天生就是“夜型人”基因！
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颠覆！垃圾DNA不是垃圾！活细胞成像实时演绎基因调控全过程！
Nature重磅！肥胖有救了：分析了362499个人，发现了98个与肥胖相关的遗传信号，其中29个是第一次发现
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整天泡实验室已经out了，会写代码才是不被淘汰的关键
Science文章背靠背揭示癌症中细胞感应氧气的新机制
跟随美国博导12年，我学到最深刻的不是科研，而是这个。。。
用PCR之歌怀念PCR之父凯利·穆利斯：生物学从此人分为PCR之前，PCR之后
最会数据分析的护士！全世界最有名的白衣天使是如何走上可视化之路的？
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学生说 |当代硕博生常犯错觉图鉴
整合基因组学和蛋白质结构的致病机制分析
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你转发的四倍体锦鲤还好吗？NC首次鉴定出异源四倍体鱼类的祖先二倍体并成功进行亚基因组拆分
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Cell 单细胞文章 | 白凡课题组与合作团队揭示儿童结肠炎及炎症性肠病的致病机制及治疗方法
城市里的穷人最容易“喜当爹”，但概率也没你想得那么高
国际顶刊《PNAS》：爱发朋友圈的人，更容易长寿
你在办公室呼吸的每口空气，都有来自同事洗发水的污染物
Cell子刊 | 植物单细胞转录组综述·植物功能基因组学的高分辨率研究方法
Cell子刊 | 肠内分泌细胞单细胞测序分析（附资源库传送门）
这篇5分文章不做实验，纯数据挖掘发现调控乳腺癌细胞增殖与预后的关键蛋白激酶
Science：请注意了，当人们讲话用到这个词时，可能是在描述负面体验！
比较基因组学揭示海洋最深鱼类嗅觉的适应性进化
还以为”猪脑子”是在骂人？这篇文章告诉你，猪的智商高到爆表
实验和检测技术带来的高假阳性乌云：6mA是否真的在哺乳动物中广泛存在？
众志成城 – 财经、医学、数学、古脊椎多领域团队19文解析新型冠状病毒 – 起源、传播、防控 – 为决策助力
因为2万人自愿被感染，首个人类冠状病毒才被发现
电脑仿真程序揭秘：为何现在还不能出门？
既没新样本，也没实验，如何猜到新冠病毒“喜欢”感染哪些细胞？
再添力证，还是穿山甲！管轶教授从被走私的穿山甲中发现新冠病毒
中国人是否对新冠病毒更易感？
你的大脑、肝脏和肠胃，都是“傻帽”？
蚯蚓不生活在水中，鱼为什么喜欢吃它？
Cell|严景华/齐建勋首次发现新冠病毒进入细胞的详细分子细节
香港大学做了三个新冠病毒重磅实验，信息量很大…
史上最完善人类新陈代谢谱系模型登上《科学》封面！支持3D交互
当细胞生物学遇上计算机思维，会产生什么样的火花？
漫画科普：陈玲玲研究组发现长非编码RNA种属特异性加工决定其功能差异
一口气看够人类染色体故事，痛快！
NatureGenetics：所有五个异源四倍体棉花起源被厘清
吃了一辈子大米，你还在相信水稻种水里是因为喜欢水？
Nature Communications | 白凡研究组揭示结直肠癌近端淋巴结与远端器官的转移路径
JAMA子刊：20来岁就要控制体重！分析超8万中国人数据发现，成年到中年体重每多增加10斤，老了之后死亡风险增加10%
BMJ二十年最火论文：性行为时生殖器会变成什么样子？
结肠癌个性化治疗新手段——基于类器官的Cas9筛选平台 | Cell Press 青促会述评
智商随妈，性格随爸？遗传学家们找到了这些证据
人类细胞图谱计划发起人Aviv Regev博士讲单细胞基因组学
获得诺贝尔奖之后影响力会下降？绘制精英科学家的职业生涯路线图
Nature: 你的肠道菌群是遗传自你父母还是后天
Cell: 为了PK抗生素而服用益生菌？后果竟然如此严重
Nature重磅突破：人造卵细胞成为现实——使用转录因子重建卵母细胞转录网络
Nature Reviews Cancer综述：长非编码RNA在肿瘤转移中的作用
益生菌拯救“社恐”？肿瘤攘外安内？胎盘似癌？这个世界怎么了。。。
一篇综述翻译解读文章的发出也需要数易其稿
2019的高阅读文章合集
跟随美国博导12年，我学到最深刻的不是科研，而是这个。。。
用PCR之歌怀念PCR之父凯利·穆利斯：生物学从此人分为PCR之前，PCR之后
著名养生专家因病逝世，享年59岁，寿命基因决定还是养生决定？
最新发表的这篇《细胞》论文，颠覆了太多认知……
保护导师，从我做起；爱护博导，人人有责
这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350次
是Excel的图，不！是R的图
SCI-HUB客户端（文献神器V4.0）——下载文献如此简单
2019影响因子分享下
增强火山图，要不要试一下？
Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图
Science组合图表解读
《自然》：真是绝了！科学家发现癌细胞竟会把自己伪装成比正常细胞健康的“赢家”，然后通过未知手段干掉健康的邻居 | 科学大发现
无需写代码的高颜值富集分析神器
一个震撼的交互型3D可视化R包 – 可直接转ggplot2图为3D
博士出身好科研产出高，学术谱系真的可以决定一切吗？
研究基因50年后，这位院士说基因决定了智力，别操心育儿了
原来Rstudio还可以这么使用，又方便了一些
综述之我的十年本硕博生活
万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等
“你都硕士博士了，竟然还不如我！”
Manuscript match— 找到最适合你文章的那个ta（之期刊杂志）
当我们谈论生信的时候我们在谈什么
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RNA-seq最强综述名词解释&思维导图|关于RNA-seq，你想知道的都在这（续）
美国科学院公布未来10年农业发展的五大方向，生物信息和微生物组占两项！
国际顶刊《PNAS》：爱发朋友圈的人，更容易长寿
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学术谱系树：来看看你导师的师承
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人体上的生命：看完此片我想把身上的细菌寄生虫供起来
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Sciences：用膳食纤维”钓”出15株缓解糖尿病的细菌！
Nature: 来自细菌的通告——群体感知效应
Nature：皮肤微生物群-宿主相互作用
Nature综述：人类微生物培养及培养组学culturomics
NRM: 蓝藻水华的形成机理及防治动态
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NRM: 追“根”溯源：植物根际的微生物生态
NRM 关键物种对于微生物菌群结构和功能的驱动作用
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PNAS: 干旱延缓高粱根系微生物组的建成并富集革兰氏阳性菌
NAR：MicrobiomeAnalyst微生物组分析师——统计、可视化和元分析微生物组数据的网页工具
Nature综述：微生物的社交网络 – 营养缺陷型如何塑造复杂群落
Cell综述：人类肠道菌群-从关联到调控
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Nat Rev Microbiol：呼吸道菌群—呼吸道健康的守门人
Nat. Plant: 可持续农业生态系统中的核心微生物组
Cell：代谢控制中的脑肠轴
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微生物组学研究的可再现性、可重现性、稳定性与普适性
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Nature Microbiology：微生物与海洋全球变化
NBT：根际微生物组抗番茄枯萎病
Nature：益生菌清除致病菌的机制 科普：原来益生菌是这么搞定致病菌的
Nature: 高通量细菌分离培养鉴定
Nature：根系菌群参与磷胁迫和免疫的平衡
Nature: EMP揭示地球多尺度微生物多样性
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Nature：人类肠道微生物组的肠型
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Nature：肠道菌群代谢物调节肠道与免疫
Nature: 拟南芥根微生物组的结构和组成
Nature: 地球上最古老的热液喷口发现早期生命迹象
Nature: 甘露糖苷选择性抑制致病性大肠杆菌
Nature：乙酸盐通过介导微生物-脑-β细胞轴促进代谢综合征
Nature：人工甜味剂改变小鼠肠道菌群组成及功能
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Nature-2018-抗菌药物组合有望特异性治疗耐多药性的细菌感染
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NC.：降低微生物群落复杂度突破组装难题
NC：宏基因组学提示曙古菌门的代谢和进化(中大李文均组)
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Microbiome：HiSeq平台16S扩增子文库构建方法
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Microbiome: 简单套路发高分文章—杨树微生物组
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Nat. Med.:菌群与疾病的关：先有鸡还是先有蛋？
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ISME宏转录组揭示参与深海碳氮循环的微生物
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西游记里河水让人怀孕的秘密：是寄生虫！
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